Elafonisi är en avlång, som ofta ”bryter” i två delar av vatten vilket ger intryck av att vara en separat ö och ett ”Natura 2000” skyddat område. Ön är full av sanddyner med sandliljor och enar (som cederträd). De utrotningshotade sköldpaddorna Caretta-Caretta och flera sällsynta djur häckar på ön och det är strängt förbjudet att ta bort några växter, djur från området. Exotisk strand med vit sand och turkost vatten, som påminner om Karibien, bildas på båda sidor av halvön. Sanden är rosaaktig på många ställen och tar sin färg från tusentals trasiga skal. Nära halvöns ”brytpunkt” överstiger vattnet inte 1 m, vilket skapar en liten lagun, perfekt för barn.