Ratu Boko ligger cirka 3 kilometer söder om Prambanan-templet, på en kulle cirka 195,97 meter över havet. Till skillnad från typiska antika tempel är Ratu Boko faktiskt resterna av ett palatskomplex. Av denna anledning kallas det ofta Kraton Ratu Boko. Enligt den lokala legenden var denna plats en gång i tiden palatset för Ratu Boko, far till Lara Jonggrang.
Ratu Boko-komplexet tros ha grundats på 800-talet av buddhisterna Syailendra Dynasty och senare övertagits av de hinduiska härskarna i Mataram. Detta maktskifte resulterade i arkitektoniska och kulturella element som påverkades av både Buddhism och Hinduism.
Ett av de viktigaste fynden på platsen är Abhayagiriwihara Inscription, daterad till 792 e.Kr. Den är skriven i pranagari - ett kännetecken för buddhistiska inskriptioner - och anger att kung Tejapurnama Panangkarana, som tros vara Rakai Panangkaran, beordrade byggandet av Abhayagiriwihara. Hans namn förekommer också i flera andra historiska inskriptioner, bland annat Kalasan Inscription (779 AD), Mantyasih Inscription (907 AD), och Wanua Tengah III Inscription (908 AD).
Termen abhaya betyder “frid” och giri betyder “kulle”, så Abhayagiriwihara översätts till “ett kloster byggt på en fridfull kulle”. Under Rakai Walaing Pu Kombayoni (898-908 e.Kr.) döptes klostret om till Kraton Walaing.
Ratu Boko-anläggningen sträcker sig idag över ett stort område och består av flera byggnadsgrupper. Även om många strukturer nu ligger i ruiner är platsen fortfarande ett viktigt historiskt landmärke med en rik blandning av kulturellt och arkitektoniskt arv.