Att planera för vädret är viktigt för att göra din vistelse i Ayder så lyckad som möjligt. De varmaste månaderna är vanligtvis augusti och juli, med en medeltemperatur på 21 °C. De kallaste månaderna är januari och februari, då medeltemperaturen är 7 °C. De blötaste månaderna i Ayder är oktober, september, november och mars, med en genomsnittlig nederbörd på 220 mm per månad.