Att planera för vädret är viktigt för att göra din resa till Barra de São Miguel så lyckad som möjligt. De varmaste månaderna är vanligtvis mars och februari, med en medeltemperatur på 27 °C. De kallaste månaderna är augusti och juli, då medeltemperaturen är 24 °C. Den årliga nederbörden i Barra de São Miguel är i genomsnitt 1041 mm.