Att planera för vädret är viktigt för att göra din vistelse i Bwindi så minnesvärd som möjligt. De varmaste månaderna är vanligtvis februari och juli, med en medeltemperatur på 20 °C. De kallaste månaderna är december och november, då medeltemperaturen är 19 °C. De blötaste månaderna i Bwindi är april, maj, oktober och september, med en genomsnittlig nederbörd på 292 mm per månad.