Vädret är mycket viktigt när du planerar en resa till Cabo Polonio, och mer prisvärda alternativ går ofta att hitta under perioder då vädret inte är lika fint. De varmaste månaderna är vanligtvis januari och februari, med en medeltemperatur på 21 °C. De kallaste månaderna är juli och augusti, då medeltemperaturen är 12 °C. Den årliga nederbörden i Cabo Polonio är i genomsnitt 1386 mm.