Att planera för vädret är viktigt för att göra din vistelse i El Peñol så lyckad som möjligt. De varmaste månaderna är vanligtvis augusti och september, med en medeltemperatur på 17 °C. De kallaste månaderna är januari och juli, då medeltemperaturen är 17 °C. De blötaste månaderna i El Peñol är april, maj, oktober och november, med en genomsnittlig nederbörd på 439 mm per månad.