Att planera för vädret är viktigt för att göra din resa till Kukës så lyckad som möjligt. De varmaste månaderna är vanligtvis augusti och juli, med en medeltemperatur på 19 °C. De kallaste månaderna är januari och februari, då medeltemperaturen är 3 °C. Den årliga nederbörden i Kukës är i genomsnitt 1104 mm.