Vädret är mycket viktigt när du planerar en resa till Kvarnåkershamn, och de billigare alternativen hittar du ofta under perioder då vädret inte är lika bra. De varmaste månaderna är vanligtvis augusti och juli, med en medeltemperatur på 16 °C. De kallaste månaderna är februari och januari, då medeltemperaturen är 2 °C. Den årliga nederbörden i Kvarnåkershamn är i genomsnitt 572 mm.