Att planera för vädret är viktigt för att göra din vistelse i Kvarnåkershamn så minnesvärd som möjligt. De varmaste månaderna är vanligtvis augusti och juli, med en medeltemperatur på 16 °C. De kallaste månaderna är februari och januari, då medeltemperaturen är 2 °C. Den årliga nederbörden i Kvarnåkershamn är i genomsnitt 572 mm.