Vädret är mycket viktigt när du planerar en resa till La Merced, och mer prisvärda alternativ går ofta att hitta under perioder då vädret inte är lika fint. De varmaste månaderna är vanligtvis september och oktober, med en medeltemperatur på 21 °C. De kallaste månaderna är juli och augusti, då medeltemperaturen är 20 °C. De blötaste månaderna i La Merced är februari, januari, december och mars, med en genomsnittlig nederbörd på 342 mm per månad.