Vädret är mycket viktigt när du planerar en resa till Madiun, och mer prisvärda alternativ går ofta att hitta under perioder då vädret inte är lika fint. De varmaste månaderna är vanligtvis oktober och september, med en medeltemperatur på 27 °C. De kallaste månaderna är juli och augusti, då medeltemperaturen är 26 °C. De blötaste månaderna i Madiun är februari, mars, december och januari, med en genomsnittlig nederbörd på 402 mm per månad.