Att planera för vädret är viktigt för att göra din resa till Miyazaki så lyckad som möjligt. De varmaste månaderna är vanligtvis augusti och juli, med en medeltemperatur på 25 °C. De kallaste månaderna är januari och februari, då medeltemperaturen är 10 °C. De blötaste månaderna i Miyazaki är juni, juli, september och augusti, med en genomsnittlig nederbörd på 375 mm per månad.