Att planera för vädret är viktigt för att göra din vistelse i Nakhon Pathom så lyckad som möjligt. De varmaste månaderna är vanligtvis april och mars, med en medeltemperatur på 30 °C. De kallaste månaderna är december och januari, då medeltemperaturen är 27 °C. De blötaste månaderna i Nakhon Pathom är september, oktober, augusti och maj, med en genomsnittlig nederbörd på 220 mm per månad.