Vädret är mycket viktigt när du planerar en resa till Nikkaluokta, och mer prisvärda alternativ går ofta att hitta under perioder då vädret inte är lika fint. De varmaste månaderna är vanligtvis juli och augusti, med en medeltemperatur på 9 °C. De kallaste månaderna är januari och februari, då medeltemperaturen är -12 °C. Nikkaluokta ser mest snöfall i januari, december, mars och februari, med ett genomsnitt på 95 cm snö per månad.