Vädret är mycket viktigt när du planerar en resa till Otjiwarongo, och de billigare alternativen hittar du ofta under perioder då vädret inte är lika bra. De varmaste månaderna är vanligtvis oktober och november, med en medeltemperatur på 24 °C. De kallaste månaderna är juli och juni, då medeltemperaturen är 18 °C. Den årliga nederbörden i Otjiwarongo är i genomsnitt 463 mm.