Vädret i San Diego de la Unión kan vara bra att kolla upp om du vill maximera tiden vid poolen under din vistelse. De varmaste månaderna är vanligtvis maj och april, med en medeltemperatur på 19 °C. De kallaste månaderna är januari och december, då medeltemperaturen är 14 °C. Den årliga nederbörden i San Diego de la Unión är i genomsnitt 674 mm.