Vädret är mycket viktigt när du planerar en resa till San Lorenzo, och de billigare alternativen hittar du ofta under perioder då vädret inte är lika bra. De varmaste månaderna är vanligtvis januari och december, med en medeltemperatur på 25 °C. De kallaste månaderna är juli och juni, då medeltemperaturen är 13 °C. Den årliga nederbörden i San Lorenzo är i genomsnitt 1149 mm.