Att planera för vädret är viktigt för att göra din resa till Sankt Kanzian am Klopeiner See så lyckad som möjligt. De varmaste månaderna är vanligtvis juli och augusti, med en medeltemperatur på 17 °C. De kallaste månaderna är januari och februari, då medeltemperaturen är 0 °C. Den årliga nederbörden i Sankt Kanzian am Klopeiner See är i genomsnitt 1398 mm.