Vädret spelar stor roll när du planerar en resa till Septemvri, och mer prisvärda alternativ går ofta att hitta under perioder då vädret inte är lika fint. De varmaste månaderna är vanligtvis augusti och juli, med en medeltemperatur på 21 °C. De kallaste månaderna är januari och februari, då medeltemperaturen är 4 °C. Den årliga nederbörden i Septemvri är i genomsnitt 630 mm.