Vädret spelar stor roll när du planerar en resa till Shinjo, och mer prisvärda alternativ går ofta att hitta under perioder då vädret inte är lika fint. De varmaste månaderna är vanligtvis augusti och juli, med en medeltemperatur på 20 °C. De kallaste månaderna är februari och januari, då medeltemperaturen är 0 °C. De blötaste månaderna i Shinjo är juli, augusti, december och september, med en genomsnittlig nederbörd på 234 mm per månad.