Att planera för vädret är viktigt för att göra din vistelse i San Bartolo så lyckad som möjligt. De varmaste månaderna är vanligtvis februari och mars, med en medeltemperatur på 21 °C. De kallaste månaderna är augusti och september, då medeltemperaturen är 17 °C. Den årliga nederbörden i San Bartolo är i genomsnitt 133 mm.